新型パンデミックインフルエンザの出現予測に資することを目的として、インフルエンザウイルスの宿主動物の一つである豚の気管上皮細胞表面に、人と鳥のインフルエンザウイルスの両方に親和性のあるレセプター物質が存在することを明らかにした。このことは豚が鳥と人のウイルスの遺伝子再集合体を生み出す環境を提供していることを示している。また、この発見は、人の新型インフルエンザウイルスの出現機序を説明し、豚の継続的な監視の必要性を強く支持するものとなった。今後は異なる動物由来インフルエンザウイルスの宿主域制限因子に関する研究をさらに推進し、当該ウイルスの異動物種間伝播機序の分子レベルでの解明を目指している。

野生水禽由来の低病原性鳥インフルエンザウイルスを鶏の気嚢で24代、脳で5代継代して得られた病原性獲得変異株は、本ウイルスが鶏体内での増殖を繰り返す間に、そのHA開裂部位に、段階的に遺伝子変異が導入・蓄積され、最終的に鶏に対する致死率100％の高病原性ウイルスに変化した。これらの成績は、自然界においても野生水禽で維持されている低病原性ウイルスが、偶発的に鶏に伝播し、鶏で循環している間に高病原性ウイルスに変化する可能性を示している。現在はリバースジェネティクス法で作出した人工変異ウイルスを用いて、その病原性獲得変異機序の分子レベルでの更なる解明を目指している。

インフルエンザAウイルスM遺伝子の進化系統学的解析を行い、この遺伝子が少なくとも4つの異なる宿主関連系統に分かれて進化したことを明らかにした。またM1およびM2遺伝子と各々の転写産物の解析から、このバイシストロン性遺伝子では1つの蛋白の進化が、他の蛋白の進化に影響し得ることを明らかにした。このように確立されたインフルエンザウイルス遺伝子の進化系統学的解析によって、現在は特に高病原性鳥インフルエンザの国内流行における感染源の特定や国内侵入経路の推定研究を通じて、今後の国内流行拡大防止体制の確立を目指している。